Intel Thunderbolt to technologia, która gwarantuje dwa razy wyższą przepustowość niż USB 3.0. Thunderbolt pozwala na przesyłanie danych z szybkością 10 Gb/s (1,25 GB/s). Dla porównania USB 3.0 w najlepszym razie pozwala na 5 Gb/s. Oczywiście ze starszymi urządzeniami szybkość transmisji danych jest odpowiednio obniżana.
Patrz też: Największy w historii atak na Pentagon: Wirus na klipsie USB zainfekował komputery
W najnowszym komputerach Apple MacBook obok USB 2.0 pojawią się sloty Intel Thunderbolt. Obsługa obu technologii - Intel Thunderbolt i USB 3.0 - pojawiła się w chipsetach Santa Clara.
Niektórzy analitycy rynku wieszczą, że może to oznaczać koniec USB 3.0 - które nie zdoła się przebić przy lepszej technologii.
W rzeczywistości jednak USB 3.0 ma jedną niepodważalną zaletę: wsteczną kompatybilność. Użytkownik woli przesłać zdjęcia z aparatu wolniej, ale je przesłać, niż dowiedzieć się, że nie może ich przesłać, bo ma zbyt starego laptopa. Thunderbolt teoretycznie obsługuje Firewire, USB, Ethernet i inne protokoły - ale za każdym razem wymagana jest właściwa końcówka (wtyczka) przewodu. Przy każdym połączeniu Thunderbolt-Firewire czy Thunderbolt-USB konieczny będzie osobny kabel.